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生物信息学问题

发布时间:2024-01-14 08:21来源:www.sf1369.com作者:宇宇

不知道楼主这个问题是作为课程习题出现的还是一般性的讨论。

如果是课本中的习题,那么就是可以得到。因为归根究底,蛋白质的结构是由其相应的基因决定的,这是无可厚非的。此外,关于蛋白质的研究也表明,蛋白质的高级结构是由其低级结构决定的,也就是说蛋白质的高级结构都是有其一级结构——氨基酸序列所决定的,而决定氨基酸序列的毫无疑问是基因。

如果是深究这个问题,也有其他方面需要考虑,蛋白质的高级结构,特别是三级结构、四级结构和蛋白质所处的环境有着密切关系,比如说,相同的酶,在不同的环境下的生物学作用有差异,这个差异是酶的空间结构不同所导致的,也就是酶的三维结构不同所导致的。

所以说,能否得到它的三维结构从理论上来说是可能的,前提是必须明确其DNA序列,并进可能分析其所处的环境。

至于如何得到,这是超出理论范围的,蛋白质自然折叠的速度异常的快,是人工完全无法模拟的(一些非常短小的蛋白质除外)。

目前比较引人关注的是计算机模拟体内蛋白质的折叠,这就是著名的“Folding@Home”计划,这个计划是由美国斯坦福大学的一位生物学学者提出的,主要是利用当今强大的计算机处理能力,特别是显卡的物理加速能力。在于AMD和Intel公司取得合作和支持后以在全世界进行。

不过据我了解,这项计划并未取得实质性的进展,因为目前的云计算还没有完善,每台电脑的计算数据大多数重复切无意义。

如果楼主想要了解相关,可以百度“Folding@Home”,而且楼主如果注意到,可以发现在安装较新的显卡驱动程序时会附带有这个程序。通过这个程序楼主可以清楚地看到,在体外模拟蛋白质的折叠的效率同体内蛋白质折叠简直是天壤之别!

谢谢!